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A、花在结构层次上属于器官，A错误；
B、制作杨梅酒时用到的微生物是酵母菌，B错误；
C、胃的内表面由上皮细胞构成，属于上皮组织．胃壁里面主要是肌肉组织，能收缩和舒张促进胃的蠕动来消化食物．整个的胃布满了丰富的血管和神经，血管里的血液属于结缔组织，神经属于神经组织．因此胃是由上皮组织、肌肉组织、结缔组织和神经组织按照一定的次序结合在一起构成的一个器官．C正确；
D、细胞分裂就是一个细胞分成两个细胞的过程．通过细胞分裂产生的新细胞与原细胞所含的遗传物质相同．D正确；
故选：C、D

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